Садржај
Стопа мутације је шанса да нуклеотид буде изостављен или промењен у ДНК узрокован природним грешкама у обради ДНК (спонтана мутација) или спољним агенсима (индукована мутација). Ову стопу не треба мешати са учесталошћу мутације, што је број појава мутација у датој генерацији. Стопа мутације за одређену врсту обично се екстраполира из података, упоређујући све ДНК секвенце у пресеку врста са онима њихових потомака. У лабораторији се то обично ради изоловањем узорка врста и омогућавањем да се множе током неколико генерација.
Израчунавање стопе мутације врста
Корак 1
Да бисте олакшали поступак, узмите групу узорака хермафродитних врста (које оплођују своја јајашца и не захтевају партнере) које се брзо размножавају и за које можете репродуковати животне услове у лабораторији. Цаенорхабдитис Елеганс је мала врста округлог црва која испуњава ове критеријуме и раније је тестирана на стопу мутације.
Корак 2
Заредите и забележите ДНК своје врсте.
3. корак
Изолујте што више јединки различитих врста да бисте могли да управљате, одржавате и посматрате дужи временски период под условима под којима је познато да ово биће успева. Ово смањује ефекат природне селекције смањењем вашег генетског узорка.
4. корак
За сваку генерацију врста држите само једно потомство.
Корак 5
Дозволите што већем броју генерација да устане и умре, бележећи тачно колико је генерација прошло за сваку лозу.
Корак 6
Узмите случајни или потпуни узорак ДНК од вашег коначног потомства и упоредите га са редоследом изворне врсте. Пребројите број промена.
Корак 7
На крају експеримента користите следећу једначину да бисте израчунали стопу мутације за своју врсту: µ = м / (Л к г к б)
где су: µ = брзина мутације м = број уочених мутација Л = број експерименталних сојева г = просечан број генерација б = број секвенцираних парова база